Flatpak es una segunda forma de distribuir software en RHEL, orientada principalmente a aplicaciones de escritorio. Una aplicación Flatpak se empaqueta junto con un runtime, un conjunto compartido de bibliotecas sobre el que se ejecuta, y se ejecuta en un sandbox (entorno aislado) que limita a qué puede acceder en el host. Como las aplicaciones traen su propio runtime, se pueden actualizar de forma independiente de los paquetes RPM del sistema operativo. Los objetivos actuales del EX200 incluyen configurar repositorios Flatpak y gestionar aplicaciones Flatpak.
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